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sdf(結構數據文件)是一種化學結構存儲和交換文件格式,由 acs 開發。它包含頭信息、分子信息和屬性信息,用於存儲分子拓撲結構、鍵合和附加數據。sdf 文件廣泛用於化學信息學,包括存儲和共享分子結構、進行分子數據庫搜索、化學計算、可視化和分析。其特點在於廣泛應用、開放標準以及靈活性和可擴展性。
什麼是 SDF 文件?
SDF(結構數據文件)是一種用於存儲和交換化學結構信息的文件格式。它由美國化學學會 (ACS) 開發,用於描述分子結構及其關聯的數據。
SDF 文件結構
SDF 文件包含一系列記錄,每條記錄描述一個分子。每個記錄由以下部分組成:
- 頭信息:包含文件的版本信息、記錄的計數以及可選註釋。
- 分子信息:描述分子的拓撲結構、鍵合和原子信息。
- 屬性信息:包含與分子相關的附加數據,例如物理化學性質或生物活性。
SDF 文件的使用
SDF 文件廣泛用於化學信息學領域,用於:
- 存儲和共享分子結構:SDF 文件是存儲和共享分子結構的標準格式。
- 分子數據庫搜索:SDF 文件可加載到數據庫中,以便對分子特性進行搜索和檢索。
- 化學計算:SDF 文件中的分子信息可用於進行各種化學計算,例如藥物設計或材料模擬。
- 可視化和分析:SDF 文件可導入到分子可視化和分析軟件中,以便繪製分子結構並分析其特性。
SDS 文件的優勢
- 廣泛應用:SDF 文件是化學信息學領域廣泛使用的格式。
- 開放標準:SDF 格式是免費和公開的,可由任何軟件讀取和寫入。
- 靈活性和可擴展性:SDF 文件可以存儲廣泛的分子信息,並且可以擴展爲包含其他類型的數據。
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