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sdf(结构数据文件)是一种化学结构存储和交换文件格式,由 acs 开发。它包含头信息、分子信息和属性信息,用于存储分子拓扑结构、键合和附加数据。sdf 文件广泛用于化学信息学,包括存储和共享分子结构、进行分子数据库搜索、化学计算、可视化和分析。其特点在于广泛应用、开放标准以及灵活性和可扩展性。
什么是 SDF 文件?
SDF(结构数据文件)是一种用于存储和交换化学结构信息的文件格式。它由美国化学学会 (ACS) 开发,用于描述分子结构及其关联的数据。
SDF 文件结构
SDF 文件包含一系列记录,每条记录描述一个分子。每个记录由以下部分组成:
- 头信息:包含文件的版本信息、记录的计数以及可选注释。
- 分子信息:描述分子的拓扑结构、键合和原子信息。
- 属性信息:包含与分子相关的附加数据,例如物理化学性质或生物活性。
SDF 文件的使用
SDF 文件广泛用于化学信息学领域,用于:
- 存储和共享分子结构:SDF 文件是存储和共享分子结构的标准格式。
- 分子数据库搜索:SDF 文件可加载到数据库中,以便对分子特性进行搜索和检索。
- 化学计算:SDF 文件中的分子信息可用于进行各种化学计算,例如药物设计或材料模拟。
- 可视化和分析:SDF 文件可导入到分子可视化和分析软件中,以便绘制分子结构并分析其特性。
SDS 文件的优势
- 广泛应用:SDF 文件是化学信息学领域广泛使用的格式。
- 开放标准:SDF 格式是免费和公开的,可由任何软件读取和写入。
- 灵活性和可扩展性:SDF 文件可以存储广泛的分子信息,并且可以扩展为包含其他类型的数据。
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